RNA polymeráza

Z Multimediaexpo.cz

(Rozdíly mezi verzemi)

Aktuální verze z 2. 9. 2013, 08:41

Bakteriální RNA polymeráza; na obrázku z bakterie Thermus aquaticus

RNA polymeráza (RNAP) je enzym, který katalyzuje syntézu RNA podle vzoru - příslušné části řetězce DNA (či vzácně podle jiné [RNA]). Díky tomuto enzymu vznikají mezi danými nukleosidtrifosfáty (ATP, CTP, GTP, UTP) fosfodiesterové vazby, čímž se spojují do řetězce několika tisíc nukleotidů. RNA polymeráza hraje klíčovou roli v procesu transkripce.^[1] RNA polymeráza udělá chybu jednou za 10⁴ nukleotidů, tedy asi 1000× častěji, než DNA polymeráza (po proofreadingu).^[1] Regulaci transkripce zajišťují zejména tzv. transkripční faktory, které se mnohdy vážou na RNA polymerázu.

Obsah

1 Klasifikace
2 Typy RNA polymeráz
- 2.1 U bakterií
- 2.2 U eukaryot
3 Odkazy
- 3.1 Reference
- 3.2 Související články

Klasifikace

Rozlišují se:^[2]

DNA-dependentní RNA polymerázy – vzorem pro jejich činnost je řetězec DNA
RNA-dependentní RNA polymerázy – vzorem pro jejich činnost je řetězec RNA, jedná se spíše o výjimku.

Typy RNA polymeráz

U bakterií

Bakterie mají zřejmě jedinou RNA polymerázu, ta je však složená z několika podjednotek:^[2]

α podjednotka (velikost 36,5 kDa) – váže se na promotor;
β′ podjednotka (155,2 kDa) – váže se na DNA;
β podjednotka (150.6 kDa) – umožňuje samotnou polymerizační aktivitu
σ podjednotka (sigma faktor) – významná pro iniciaci transkripce (otevře dvoušroubovici).

U eukaryot

U eukaryot jsou tři základní typy DNA polymeráz,^[1] všechny jsou složené z mnoha podjednotek (například RNAP jich má kolem 12^[2]):

RNA polymeráza I - přepisuje většinu rRNA
RNA polymeráza II - přepisuje všechnu DNA přepisovanou na proteiny a některé malé jaderné RNA (například RNA přítomnou v spliceozomech)
RNA polymeráza III - přepisuje tRNA, část rRNA a některé malé strukturní RNA

U rostlin se vyskytuje navíc i tzv. RNA polymeráza IV (přepisuje siRNA).^[3] Archea mají zřejmě jen jedinou RNA polymerázu, nápadně podobnou těm eukaryotickým.^[4]

Odkazy

Reference

↑ ^1,0 ^1,1 ^1,2 ALBERTS, Bruce, et al Essential Cell Biology. 2. vyd. New York : Garland Science, 2004.
↑ ^2,0 ^2,1 ^2,2 RÉDEI, George P.. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. 3rd Edition. vyd. [s.l.] : Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2.
↑ Herr AJ, Jensen MB, Dalmay T, Baulcombe DC. RNA polymerase IV directs silencing of endogenous DNA. Science, 2005, roč. 308, čís. 5718, s. 118–20. DOI:10.1126/science.1106910. PMID 15692015.
↑ D Langer, J Hain, P Thuriaux and W Zillig (1995) Transcription in Archaea: Similarity to that in Eucarya PNAS 92 5768-5772

Související články

Náklady na energie a provoz naší encyklopedie prudce vzrostly. Potřebujeme vaši podporu... Kolik ?? To je na Vás. Náš FIO účet — 2500575897 / 2010
Informace o článku. Článek je převzat z Wikipedie, otevřené encyklopedie, do které přispívají dobrovolníci z celého světa. Tento text je dostupný za podmínek Creative Commons 3.0 Unported – creativecommons.org. Originální článek na české Wikipedii

[essent-0] 1,0 ^1,1 ^1,2 ALBERTS, Bruce, et al Essential Cell Biology. 2. vyd. New York : Garland Science, 2004.

[redei-1] 2,0 ^2,1 ^2,2 RÉDEI, George P.. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. 3rd Edition. vyd. [s.l.] : Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2.

[2] Herr AJ, Jensen MB, Dalmay T, Baulcombe DC. RNA polymerase IV directs silencing of endogenous DNA. Science, 2005, roč. 308, čís. 5718, s. 118–20. DOI:10.1126/science.1106910. PMID 15692015.

[3] D Langer, J Hain, P Thuriaux and W Zillig (1995) Transcription in Archaea: Similarity to that in Eucarya PNAS 92 5768-5772

[1]

[2]

[3]

[4]